MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 109952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009525	CAC	2	6	228594	228599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659958
5502	NC_009525	CTA	2	6	228670	228675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659958
5503	NC_009525	GCT	2	6	228714	228719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5504	NC_009525	TGC	2	6	228725	228730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5505	NC_009525	GCC	2	6	228764	228769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659958
5506	NC_009525	GCT	2	6	228771	228776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5507	NC_009525	CCAC	2	8	228785	228792	25 %	0 %	0 %	75 %	148659958
5508	NC_009525	GTC	2	6	228826	228831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5509	NC_009525	GCG	2	6	228835	228840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659958
5510	NC_009525	GTC	2	6	228856	228861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5511	NC_009525	AGG	2	6	228875	228880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659958
5512	NC_009525	CG	3	6	228913	228918	0 %	0 %	50 %	50 %	148659958
5513	NC_009525	TGC	2	6	228924	228929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5514	NC_009525	GCT	2	6	228969	228974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5515	NC_009525	CGG	2	6	229017	229022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659958
5516	NC_009525	ATGG	2	8	229023	229030	25 %	25 %	50 %	0 %	148659958
5517	NC_009525	GCA	2	6	229040	229045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5518	NC_009525	TTG	2	6	229061	229066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659958
5519	NC_009525	GCCT	2	8	229075	229082	0 %	25 %	25 %	50 %	148659958
5520	NC_009525	CGGC	2	8	229096	229103	0 %	0 %	50 %	50 %	148659958
5521	NC_009525	CAG	2	6	229135	229140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5522	NC_009525	GC	4	8	229141	229148	0 %	0 %	50 %	50 %	148659958
5523	NC_009525	GCCG	2	8	229181	229188	0 %	0 %	50 %	50 %	148659958
5524	NC_009525	CCGGG	2	10	229308	229317	0 %	0 %	60 %	40 %	148659958
5525	NC_009525	GGT	2	6	229329	229334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659958
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5527	NC_009525	CA	3	6	229395	229400	50 %	0 %	0 %	50 %	148659958
5528	NC_009525	GGT	2	6	229417	229422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659958
5529	NC_009525	GCC	2	6	229529	229534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659958
5530	NC_009525	CGG	2	6	229562	229567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659958
5531	NC_009525	GCG	2	6	229573	229578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659958
5532	NC_009525	GAG	2	6	229585	229590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659958
5533	NC_009525	GC	3	6	229633	229638	0 %	0 %	50 %	50 %	148659958
5534	NC_009525	CGG	2	6	229653	229658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659958
5535	NC_009525	CAACGC	2	12	229660	229671	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148659958
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5537	NC_009525	GAC	2	6	229720	229725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659958
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5539	NC_009525	TGC	2	6	229772	229777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5540	NC_009525	CGC	2	6	229816	229821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659958
5541	NC_009525	CGA	2	6	229893	229898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5542	NC_009525	GT	3	6	229987	229992	0 %	50 %	50 %	0 %	148659958
5543	NC_009525	GCA	2	6	230025	230030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5544	NC_009525	CACC	2	8	230062	230069	25 %	0 %	0 %	75 %	148659958
5545	NC_009525	CGC	2	6	230086	230091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659958
5546	NC_009525	CTG	2	6	230092	230097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5547	NC_009525	CTG	2	6	230128	230133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5548	NC_009525	TGG	2	6	230135	230140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659958
5549	NC_009525	CTG	2	6	230161	230166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
5550	NC_009525	CGC	2	6	230206	230211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659958
5551	NC_009525	TGG	2	6	230230	230235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659958
5552	NC_009525	CGT	2	6	230343	230348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
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5557	NC_009525	TGG	2	6	230507	230512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659958
5558	NC_009525	GCT	2	6	230514	230519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659958
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5562	NC_009525	GAC	2	6	230740	230745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659958
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5564	NC_009525	TAC	2	6	230788	230793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659958
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5590	NC_009525	GGAA	2	8	232160	232167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_009525	CAC	2	6	232168	232173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_009525	G	6	6	232175	232180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_009525	GAG	2	6	232226	232231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_009525	TCC	2	6	232236	232241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_009525	GGT	2	6	232288	232293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659959
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5608	NC_009525	GCC	2	6	232700	232705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659959
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5611	NC_009525	CGCA	2	8	232850	232857	25 %	0 %	25 %	50 %	148659959
5612	NC_009525	TGCGC	2	10	232870	232879	0 %	20 %	40 %	40 %	148659959
5613	NC_009525	TGAT	2	8	232892	232899	25 %	50 %	25 %	0 %	148659959
5614	NC_009525	ACGT	2	8	232912	232919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_009525	GGCCG	2	10	232922	232931	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5616	NC_009525	GTG	2	6	232943	232948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_009525	ACAT	2	8	232979	232986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_009525	GCG	2	6	233001	233006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_009525	TGG	2	6	233029	233034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659960
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5622	NC_009525	ACT	2	6	233131	233136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659960
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5743	NC_009525	ATC	2	6	238007	238012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659963
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5849	NC_009525	CCGGT	2	10	242310	242319	0 %	20 %	40 %	40 %	148659966
5850	NC_009525	TGGG	2	8	242332	242339	0 %	25 %	75 %	0 %	148659966
5851	NC_009525	TAGC	2	8	242416	242423	25 %	25 %	25 %	25 %	148659966
5852	NC_009525	G	6	6	242432	242437	0 %	0 %	100 %	0 %	148659966
5853	NC_009525	CCAGCG	2	12	242444	242455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148659966
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5856	NC_009525	ACCA	2	8	242611	242618	50 %	0 %	0 %	50 %	148659966
5857	NC_009525	CAT	2	6	242649	242654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659966
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5862	NC_009525	GCC	2	6	242819	242824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5986	NC_009525	ATG	3	9	247461	247469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659970
5987	NC_009525	GCG	2	6	247479	247484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659970
5988	NC_009525	TCA	2	6	247501	247506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659970
5989	NC_009525	GGC	2	6	247595	247600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659970
5990	NC_009525	AGC	2	6	247779	247784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659970
5991	NC_009525	CGACG	2	10	247796	247805	20 %	0 %	40 %	40 %	148659970
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5993	NC_009525	CGG	2	6	247837	247842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659970
5994	NC_009525	AAC	2	6	247917	247922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659970
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5998	NC_009525	CGC	2	6	248074	248079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659970
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